在修剪根系的同时，要把盆底铺垫好，以利上盆后透气、排水。如果是新盆，应将其先放在水中浸泡片刻；让盆钵本身吸足水，否则，上盆后所浇的水大部分会被盆钵吸收，而影响黑松植株的成活。还要检查盆底排水孔是否通畅、够不够大，如排水孔不通畅或过小的，应先捅透或扩大后再上盆。盆景用盆一般都比较浅，如盆底排水孔再用瓦片遮盖，将减少盛土量，故可用塑料窗纱或筋络尚存的腐烂树叶遮盖。盖好排水孔后，先在盆钵底部放少许粗炉灰渣块，再放少许培养土，把黑松植株根系理顺后放在盆内。然后一手拿稳树木，一手向盆内加土，当盆土加到3／5左右时，把根略向上提一提，使根系伸直，再继续加土，直至把土加到理想高度。一般盆栽黑松植株的盆，土应低于盆口2～3厘米(视盆钵大小而定)，以便日后浇水不致溢出。一些浅盆，需要盆土高于盆口，这种黑松盆景常用浸水法或喷水法供给水分。向盆内填土时，还应边填边振动盆钵，填好后用手轻轻压一压，使盆土松实适当。如盆土过松，浇水后黑松容易变位，影响造型；盆土压得过实，对黑松生长不利。

上盆完毕，要浇透水，浇到盆底排水孔有少量水渗出为止。如果是浅盆，可用浸水法供水，浸到盆土表面都湿润为止，然后把黑松盆景放置在蔽荫处。从野外挖掘的老桩或根须剪除较多的树桩，为补充根系吸水不足，每天应向枝干喷水2～3次。